2023年本中心完成的海洋细菌新物种的系统分类鉴定

2023年完成原核微生物新物种鉴定9个，分属于9个不同的属。研究结果已发表在微生物新种鉴定的权威刊物International Journal of Systematicand Evolutionary Microbiology等期刊上。这些菌株分离自太平洋深海以及中国南海等近海（如下表）。

序号	属种名	中文译名	分离源	保藏号
1	Alcanivorax xiamenensis	厦门食烷菌	福建厦门市表层海水	MCCC 1A01359
2	Bacillus changyiensis	昌邑芽孢杆菌	山东潍坊市表层沉积物	MCCC 1A14857
3	Galbibacter pacificus	太平洋中黄杆菌	西太平洋表层海水	MCCC M28999
4	Pseudodonghicola flavimaris	黄海假栖韩东海菌	中国黄海底表水	MCCC 1A02763
5	Pseudophaeobacter profundi	深部暗棕色杆菌	西太平洋深层海水	MCCC M29024
6	Sedimentitalea xiamensis	厦门沉积物棍菌	福建省厦门市红树林根际土壤	MCCC 1A17756
7	Sneathiella marina	海洋斯尼斯氏菌	西太平洋甲胄海葵	MCCC M21824
8	Sulfurovum mangrovi	红树林硫卵菌	福建漳州市近海沉积物	MCCC M25234
9	Vibrio intestinalis	肠道弧菌	福建厦门市海马肠道	MCCC 1A17441

 

（1）Alcanivorax xiamenensis

种名定义：N.L. masc./fem. adj. xiamenensis, of Xiamen, the city where the type strain was isolated.

中文名：厦门食烷菌

模式菌株：6-D-6= MCCC 1A01359=KCTC 92480；分离自福建厦门市表层海水。

新种论文：Lai Q, Fu X, Wang J, Dong C, Wang L, Wang W, Shao Z. Alcanivorax xiamenensis sp. nov., a novel marine hydrocarbonoclastic bacterium isolated from surface seawater. Int J Syst Evol Microbiol. 2023 Mar;73(3). doi: 10.1099/ijsem.0.005798.

新物种特征描述：模式菌株；革兰氏阴性，该菌杆状、可运动；生长温度范围10-45℃，生长pH范围6-9，生长所需NaCl浓度范围0.5-15%；在2216E培养基上，菌落呈圆形，灰白色不透明，表面光滑湿润，边缘规则，有晕环，较小，中央凸起。

 

（2）Bacillus changyiensis

种名定义：N.L. masc./fem. adj. changyiensis, of Changyi, the city where the type strain was isolated

中文名：昌邑芽孢杆菌

模式菌株：CLL-3-40= MCCC 1A14857=JCM 35755.

新种论文：Xiao G, Lai Q, Li G, Wang S, Lin Y, Shao Z, Hu Z. Bacillus changyiensis sp. nov., isolated from coastal sediment. Int J Syst Evol Microbiol. 2023 Oct;73(10). doi: 10.1099/ijsem.0.006089.

新物种特征描述：厌氧菌（兼性）；模式菌株；革兰氏阳性，该菌杆状（长2.0-2.6um、直径0.5-0.8um），产内生孢子；生长温度范围15-50℃（最适温度37℃），生长pH5.0-9.0（最适pH7.0），最高耐受NaCl浓度为12%（适NaCl浓度为1.0-2.0%）；氧化酶和过氧化氢酶活性检测均为阴性；在MB培养基上28℃培养2天后，菌落形态呈棕红色、不透明、粗糙、边缘不规则。

 

（3）Galbibacter pacificus

种名定义：L. masc. adj. pacificus, peaceful, pertaining to the Pacific Ocean

中文名：太平洋中黄杆菌

模式菌株：CMA-7= MCCC M28999=KCTC 92588

新种论文：Wei L, Wang J, Liu X, Lai Q, Li G, Fu X, Li G, Shao Z, Dong C. Galbibacter pacificus sp. nov., isolated from surface seawater of the western Pacific Ocean and transfer of Joostella marina to the genus Galbibacter as Galbibacter orientalis nom. nov. and emended description of the genus Galbibacter. Int J Syst Evol Microbiol. 2023 Oct;73(20). doi: 10.1099/ijsem.0.006078.

新物种特征描述：模式菌株；革兰氏阴性，该菌严格好氧，杆状（长1.9-2.7um、直径0.7-0.8um）；生长温度范围10-40℃（最适温度28-32℃），生长pH6.0-8.0（最适pH7.0），生长所需NaCl浓度为0-9.0%（最适NaCl浓度为3.0%）；氧化酶和过氧化氢酶活性检测均为阳性；在MANA培养基上28℃培养3天后，菌落形态呈黄色、圆形、光滑、略微突起、边缘不规则、直径1.0-3.0mm。

 

4）Pseudodonghicola flavimaris

种名定义：L. masc. adj. flavus, yellow; L. neut. n. mare, sea; N.L. gen. neut. n. flavimaris, of the Yellow Sea, from where the type strain was isolated.

中文名：黄海假栖韩东海菌

模式菌株：IC7= MCCC 1A02763=KCTC 82844

新种论文：Huang J, Wang J, Li G, Lai Q, Zhu X, Wang S, Liu X, Shao Z, Wang L. Pseudodonghicola flavimaris sp. nov. and Sedimentitalea xiamensis sp. nov., two novel species belonging to the family Roseobacteraceae. Int J Syst Evol Microbiol. 2023 Dec;73(12). doi: 10.1099/ijsem.0.006192.

新物种特征描述：模式菌株；革兰氏阴性，该菌好氧，卵形杆状（长1.0-2.3um，直径0.5-1.3um）、不产孢子、可运动、具鞭毛；生长温度范围4-45℃（最适温度28℃），生长pH4.0-10.0（最适pH7.0），生长所需NaCl浓度为0.5-10.0%（最适NaCl浓度为2.0%）；氧化酶和过氧化氢酶活性检测均为阳性。在MA培养基上28℃培养2天后，菌落形态呈奶白色、不透明、圆形、凸起、边缘完整、直径2.0-2.5um。

 

（5）Pseudophaeobacter profundi

种名定义：L. gen. neut. n. profundi, from the depths of the sea.

中文名：深部暗棕色杆菌

模式菌株：ZH257= MCCC M29024=KACC 23147

新种论文：Zhu X, Wang L, Lai Q, Wang J, Huang J, Li G, Zeng L, Xia J, Shao Z. Pseudophaeobacter profundi sp. nov., isolated from the Western Pacific Ocean. Int J Syst Evol Microbiol. 2023 Sep;73(9). doi: 10.1099/ijsem.0.006071.

新物种特征描述：厌氧菌（兼性）；模式菌株；革兰氏阴性，该菌杆状、可运动、具鞭毛；生长温度范围4-37℃（最适温度28-32℃），生长pH6.0-9.0（最适pH7.0），生长所需NaCl浓度为2.0-9.0%（最适NaCl浓度为3.0-4.0%）；氧化酶和过氧化氢酶活性检测均为阳性；在MA培养基上28℃培养2天后，菌落形态呈奶白色、圆形、表面光滑。

 

（6）Sedimentitalea xiamensis

种名定义：N.L. masc./fem. adj. xiamensis, pertaining to Xiamen

中文名：厦门沉积物棍菌

模式菌株：JM2-8= MCCC 1A17756=KCTC 82846

新种论文：Huang J, Wang J, Li G, Lai Q, Zhu X, Wang S, Liu X, Shao Z, Wang L. Pseudodonghicola flavimaris sp. nov. and Sedimentitalea xiamensis sp. nov., two novel species belonging to the family Roseobacteraceae. Int J Syst Evol Microbiol. 2023 Dec;73(12). doi: 10.1099/ijsem.0.006192.

新物种特征描述：模式菌株；革兰氏阴性，该菌好氧，杆状（长2.0-3.0um，直径0.6-1.2um）；生长温度范围4-40℃（最适温度28℃），生长pH5.0-9.0（最适pH7.0），生长所需NaCl浓度为0-8.0%（最适NaCl浓度为1.0%）；氧化酶和过氧化氢酶活性检测均为阳性；在MA培养基上28℃培养2天后，菌落形态呈奶白色、圆形、光滑、表面湿润、略微凸起、边缘完整、直径1.0-1.5um。

 

（7）Sneathiella marina

种名定义：L. fem. adj. marina, of the sea, marine

中文名：海洋斯尼斯氏菌

模式菌株：PHK-P5= MCCC M21824=KCTC 82924

新种论文：Wei M, Li G, Lai Q, Liu T, Shao Z. Sneathiella marina sp. nov., isolated from a sea anemone in the Western Pacific Ocean. Int J Syst Evol Microbiol. 2023 Feb;73(2). doi: 10.1099/ijsem.0.005721.

新物种特征描述：模式菌株；革兰氏阴性，该菌好氧、杆状、可运动、具鞭毛；生长温度范围4-37℃（最适温度20-25℃），生长pH6.0-9.0（最适pH8.0），生长所需NaCl浓度为2.0-9.0%（最适NaCl浓度为3.0%）；氧化酶和过氧化氢酶活性检测均为阳性；在MA培养基上25℃培养72h后，菌落形态呈淡黄色、略微凸起、表面光滑、边缘完整、直径0.5-1.0mm。

 

（8）Sulfurovum mangrovi

种名定义：N.L. gen. neut. n. mangrovi, of a mangrove, referring to the isolation of the type strain from mangrove sediment

中文名：红树林硫卵菌

模式菌株：ST1-3= MCCC M25234=KCTC 25639

新种论文：Li Y, Wang S, Ji B, Yuan Q, Wei S, Lai Q, Wu K, Jiang L, Shao Z. Sulfurovum mangrovi sp. nov., an obligately chemolithoautotrophic, hydrogen-oxidizing bacterium isolated from coastal marine sediments. Int J Syst Evol Microbiol. 2023 Nov;73(11). doi: 10.1099/ijsem.0.006142.

新物种特征描述：模式菌株；革兰氏阴性，该菌杆状、不可运动，生长温度范围4-45℃（最适温度35℃），生长pH5.0-8.5（最适pH7.0），生长所需NaCl浓度为0-8.0%（最适NaCl浓度为4.0%）；氧化酶和过氧化氢酶活性检测均为阴性。

 

（9）Vibrio intestinalis

种名定义：N.L. masc./fem. adj. intestinalis, pertaining to the intestines, from where the type strain was isolated.

中文名：肠道弧菌

模式菌株：YLB-11= MCCC 1A17441=KCTC 72604

新种论文：Yu L, Wei S, Zhou Z, Shao Z. Vibrio intestinalis sp. nov., isolated from intestine of seahorse. Int J Syst Evol Microbiol. 2023 Jun;73(6). doi: 10.1099/ijsem.0.005932.

新物种特征描述：厌氧菌（兼性）；细胞革兰氏阴性，可运动，杆状，约1.6~2.1um*0.6um。菌落生长于10-45°C（最适28°C）、pH6.0~9.0（最适pH7.0）、NaCl浓度0.5~7.0%（最适4.0~5.0%，w/v）。接触酶、氧化酶阳性。未见群集运动，未见发光。基因组G+C含量为44.7 mol%. API试剂条检测到葡萄糖苷酶、丙酮生成反应、甘露糖发酵阳性；反硝化反应、吲哚生成、脲酶等阴性。

汇编：Li G. & Zhu Z.

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